Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms