Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms