Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MestQ07646 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
MestQ07646 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.63
MestQ07646 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms