Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms