Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms