Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gbx1P82976 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gbx1P82976 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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