Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gsc2P56916 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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