Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf5P56477 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms