Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcanP55066 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcanP55066 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcanP55066 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcanP55066 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcanP55066 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcanP55066 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcanP55066 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcanP55066 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NcanP55066 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcanP55066 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcanP55066 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcanP55066 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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NcanP55066 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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NcanP55066 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcanP55066 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcanP55066 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NcanP55066 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcanP55066 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcanP55066 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcanP55066 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcanP55066 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcanP55066 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcanP55066 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcanP55066 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcanP55066 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcanP55066 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcanP55066 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcanP55066 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcanP55066 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcanP55066 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcanP55066 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcanP55066 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NcanP55066 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcanP55066 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcanP55066 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcanP55066 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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