Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms