Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gbx2P48031 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gbx2P48031 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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