Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 1700125H20Rik-201ENSMUST00000018623 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm12637-201ENSMUST00000130501 368 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa2P31245 Gm5471-201ENSMUST00000072732 337 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.6 ms