Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd8P23463 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd8P23463 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd8P23463 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd8P23463 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd8P23463 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd8P23463 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd8P23463 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd8P23463 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd8P23463 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd8P23463 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd8P23463 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd8P23463 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd8P23463 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd8P23463 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd8P23463 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd8P23463 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd8P23463 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd8P23463 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd8P23463 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd8P23463 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd8P23463 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd8P23463 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd8P23463 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd8P23463 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd8P23463 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd8P23463 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd8P23463 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd8P23463 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd8P23463 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd8P23463 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd8P23463 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd8P23463 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd8P23463 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd8P23463 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd8P23463 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd8P23463 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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