Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkchP23298 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms