Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18526 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18526 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P18526 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18526 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18526 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18526 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18526 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18526 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18526 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18526 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18526 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18526 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18526 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P18526 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18526 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P18526 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18526 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18526 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18526 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P18526 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18526 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18526 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18526 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18526 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18526 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18526 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18526 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18526 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18526 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18526 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18526 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18526 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18526 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18526 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18526 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18526 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18526 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18526 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18526 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18526 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18526 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18526 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18526 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18526 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18526 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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