Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms