Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms