Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
E2f6O54917 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms