Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Sp100O35892 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Sp100O35892 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Sp100O35892 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Sp100O35892 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Sp100O35892 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sp100O35892 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Sp100O35892 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Sp100O35892 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Sp100O35892 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Sp100O35892 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Sp100O35892 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sp100O35892 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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