Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Q1O19441 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-Q1O19441 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-Q1O19441 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-Q1O19441 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-Q1O19441 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-Q1O19441 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-Q1O19441 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-Q1O19441 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms