Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casq1O09165 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casq1O09165 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casq1O09165 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casq1O09165 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Casq1O09165 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Casq1O09165 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Casq1O09165 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Casq1O09165 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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