Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Phactr1-214ENSMUST00000149235 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Odam-201ENSMUST00000113274 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Olfr1060-ps1-201ENSMUST00000118335 943 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Gm14061-201ENSMUST00000155923 1007 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Gm24962-201ENSMUST00000157917 109 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Pdlim5-205ENSMUST00000170361 2010 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Gm20455-201ENSMUST00000174100 1138 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Gm29471-201ENSMUST00000190527 700 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Gm5539-201ENSMUST00000192177 966 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Ralyl-205ENSMUST00000192209 662 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Gm36928-201ENSMUST00000192466 694 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Gm43693-201ENSMUST00000196072 1249 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Gm43582-201ENSMUST00000196149 343 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 2900060B14Rik-201ENSMUST00000203191 616 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Lyrm1-207ENSMUST00000208202 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Gm5339-201ENSMUST00000210551 1102 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 AC167250.1-202ENSMUST00000213629 672 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Gm15283-202ENSMUST00000221427 818 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 CT571256.1-201ENSMUST00000226045 585 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Olfr1461-201ENSMUST00000053772 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Gm25005-201ENSMUST00000083812 156 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Obox3-201ENSMUST00000086122 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Zfp120-202ENSMUST00000094538 1245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Pum3-201ENSMUST00000076219 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Il1bos-202ENSMUST00000156601 2425 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms