Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Tmem200cJ3QK46 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Tmem200cJ3QK46 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Tmem200cJ3QK46 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Tmem200cJ3QK46 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Tmem200cJ3QK46 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Tmem200cJ3QK46 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Tmem200cJ3QK46 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Tmem200cJ3QK46 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Tmem200cJ3QK46 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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