Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P9

Cdhr2, Cadherin-related family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdhr2E9Q7P9 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cdhr2E9Q7P9 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdhr2E9Q7P9 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms