Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms