Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms