Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rnf217D3YYI7 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rnf217D3YYI7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rnf217D3YYI7 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rnf217D3YYI7 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rnf217D3YYI7 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rnf217D3YYI7 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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