Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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