Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Scn3aA2ASI5 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Scn3aA2ASI5 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms