Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm5114W4VSN8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm5114W4VSN8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm5114W4VSN8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm5114W4VSN8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm5114W4VSN8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm5114W4VSN8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm5114W4VSN8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm5114W4VSN8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm5114W4VSN8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm5114W4VSN8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm5114W4VSN8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm5114W4VSN8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm5114W4VSN8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm5114W4VSN8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm5114W4VSN8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm5114W4VSN8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm5114W4VSN8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm5114W4VSN8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm5114W4VSN8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm5114W4VSN8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm5114W4VSN8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm5114W4VSN8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms