Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm3550W4VSN7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms