Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trip6Q9Z1Y4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trip6Q9Z1Y4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trip6Q9Z1Y4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trip6Q9Z1Y4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trip6Q9Z1Y4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trip6Q9Z1Y4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trip6Q9Z1Y4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trip6Q9Z1Y4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trip6Q9Z1Y4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Trip6Q9Z1Y4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trip6Q9Z1Y4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trip6Q9Z1Y4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trip6Q9Z1Y4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trip6Q9Z1Y4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trip6Q9Z1Y4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trip6Q9Z1Y4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trip6Q9Z1Y4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trip6Q9Z1Y4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trip6Q9Z1Y4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trip6Q9Z1Y4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trip6Q9Z1Y4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trip6Q9Z1Y4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trip6Q9Z1Y4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Trip6Q9Z1Y4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trip6Q9Z1Y4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trip6Q9Z1Y4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trip6Q9Z1Y4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trip6Q9Z1Y4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trip6Q9Z1Y4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trip6Q9Z1Y4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trip6Q9Z1Y4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Trip6Q9Z1Y4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trip6Q9Z1Y4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trip6Q9Z1Y4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trip6Q9Z1Y4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trip6Q9Z1Y4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trip6Q9Z1Y4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trip6Q9Z1Y4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trip6Q9Z1Y4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trip6Q9Z1Y4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trip6Q9Z1Y4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trip6Q9Z1Y4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trip6Q9Z1Y4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trip6Q9Z1Y4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trip6Q9Z1Y4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trip6Q9Z1Y4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trip6Q9Z1Y4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trip6Q9Z1Y4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trip6Q9Z1Y4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trip6Q9Z1Y4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trip6Q9Z1Y4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trip6Q9Z1Y4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trip6Q9Z1Y4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trip6Q9Z1Y4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trip6Q9Z1Y4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trip6Q9Z1Y4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trip6Q9Z1Y4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trip6Q9Z1Y4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trip6Q9Z1Y4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trip6Q9Z1Y4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trip6Q9Z1Y4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trip6Q9Z1Y4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trip6Q9Z1Y4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trip6Q9Z1Y4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trip6Q9Z1Y4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Trip6Q9Z1Y4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Trip6Q9Z1Y4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trip6Q9Z1Y4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Trip6Q9Z1Y4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trip6Q9Z1Y4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trip6Q9Z1Y4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trip6Q9Z1Y4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trip6Q9Z1Y4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Trip6Q9Z1Y4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trip6Q9Z1Y4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trip6Q9Z1Y4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trip6Q9Z1Y4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Trip6Q9Z1Y4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Trip6Q9Z1Y4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Trip6Q9Z1Y4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trip6Q9Z1Y4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trip6Q9Z1Y4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trip6Q9Z1Y4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trip6Q9Z1Y4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trip6Q9Z1Y4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trip6Q9Z1Y4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trip6Q9Z1Y4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trip6Q9Z1Y4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trip6Q9Z1Y4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trip6Q9Z1Y4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trip6Q9Z1Y4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Trip6Q9Z1Y4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trip6Q9Z1Y4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trip6Q9Z1Y4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Trip6Q9Z1Y4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Trip6Q9Z1Y4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms