Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms