Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.3 ms