Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1F6

Cnmd, Leukocyte cell-derived chemotaxin 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnmdQ9Z1F6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CnmdQ9Z1F6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CnmdQ9Z1F6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms