Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL6

Extl3, Exostosin-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl3Q9WVL6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Extl3Q9WVL6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Extl3Q9WVL6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Extl3Q9WVL6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Extl3Q9WVL6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Extl3Q9WVL6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Extl3Q9WVL6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Extl3Q9WVL6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Extl3Q9WVL6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Extl3Q9WVL6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Extl3Q9WVL6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Extl3Q9WVL6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Extl3Q9WVL6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Extl3Q9WVL6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Extl3Q9WVL6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Extl3Q9WVL6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Extl3Q9WVL6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Extl3Q9WVL6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Extl3Q9WVL6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Extl3Q9WVL6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Extl3Q9WVL6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Extl3Q9WVL6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Extl3Q9WVL6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Extl3Q9WVL6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Extl3Q9WVL6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Extl3Q9WVL6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Extl3Q9WVL6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Extl3Q9WVL6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Extl3Q9WVL6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Extl3Q9WVL6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Extl3Q9WVL6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Extl3Q9WVL6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Extl3Q9WVL6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Extl3Q9WVL6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Extl3Q9WVL6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Extl3Q9WVL6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Extl3Q9WVL6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Extl3Q9WVL6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Extl3Q9WVL6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Extl3Q9WVL6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Extl3Q9WVL6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Extl3Q9WVL6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Extl3Q9WVL6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Extl3Q9WVL6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Extl3Q9WVL6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Extl3Q9WVL6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Extl3Q9WVL6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Extl3Q9WVL6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Extl3Q9WVL6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Extl3Q9WVL6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Extl3Q9WVL6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Extl3Q9WVL6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Extl3Q9WVL6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Extl3Q9WVL6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Extl3Q9WVL6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Extl3Q9WVL6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Extl3Q9WVL6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Extl3Q9WVL6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Extl3Q9WVL6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Extl3Q9WVL6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Extl3Q9WVL6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Extl3Q9WVL6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Extl3Q9WVL6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Extl3Q9WVL6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Extl3Q9WVL6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Extl3Q9WVL6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Extl3Q9WVL6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Extl3Q9WVL6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Extl3Q9WVL6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Extl3Q9WVL6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Extl3Q9WVL6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Extl3Q9WVL6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Extl3Q9WVL6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Extl3Q9WVL6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Extl3Q9WVL6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Extl3Q9WVL6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Extl3Q9WVL6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Extl3Q9WVL6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Extl3Q9WVL6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Extl3Q9WVL6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Extl3Q9WVL6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Extl3Q9WVL6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Extl3Q9WVL6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Extl3Q9WVL6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms