Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU84

Ccs, Copper chaperone for superoxide dismutase, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsQ9WU84 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcsQ9WU84 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms