Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfsf13bQ9WU72 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Tnfsf13bQ9WU72 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfsf13bQ9WU72 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfsf13bQ9WU72 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfsf13bQ9WU72 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfsf13bQ9WU72 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfsf13bQ9WU72 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfsf13bQ9WU72 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfsf13bQ9WU72 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfsf13bQ9WU72 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfsf13bQ9WU72 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfsf13bQ9WU72 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfsf13bQ9WU72 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfsf13bQ9WU72 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfsf13bQ9WU72 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfsf13bQ9WU72 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfsf13bQ9WU72 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfsf13bQ9WU72 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfsf13bQ9WU72 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfsf13bQ9WU72 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfsf13bQ9WU72 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfsf13bQ9WU72 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfsf13bQ9WU72 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfsf13bQ9WU72 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfsf13bQ9WU72 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tnfsf13bQ9WU72 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.1 ms