Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX6

Cul1, Cullin-1, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul1Q9WTX6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cul1Q9WTX6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms