Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fam50bQ9WTJ8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fam50bQ9WTJ8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Fam50bQ9WTJ8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fam50bQ9WTJ8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fam50bQ9WTJ8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fam50bQ9WTJ8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fam50bQ9WTJ8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Fam50bQ9WTJ8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fam50bQ9WTJ8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fam50bQ9WTJ8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fam50bQ9WTJ8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fam50bQ9WTJ8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fam50bQ9WTJ8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fam50bQ9WTJ8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fam50bQ9WTJ8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Fam50bQ9WTJ8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fam50bQ9WTJ8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fam50bQ9WTJ8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fam50bQ9WTJ8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fam50bQ9WTJ8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fam50bQ9WTJ8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Fam50bQ9WTJ8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fam50bQ9WTJ8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fam50bQ9WTJ8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fam50bQ9WTJ8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fam50bQ9WTJ8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fam50bQ9WTJ8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fam50bQ9WTJ8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fam50bQ9WTJ8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fam50bQ9WTJ8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fam50bQ9WTJ8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fam50bQ9WTJ8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fam50bQ9WTJ8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fam50bQ9WTJ8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Fam50bQ9WTJ8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fam50bQ9WTJ8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fam50bQ9WTJ8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fam50bQ9WTJ8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fam50bQ9WTJ8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fam50bQ9WTJ8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fam50bQ9WTJ8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fam50bQ9WTJ8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fam50bQ9WTJ8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fam50bQ9WTJ8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fam50bQ9WTJ8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Fam50bQ9WTJ8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Fam50bQ9WTJ8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fam50bQ9WTJ8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fam50bQ9WTJ8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fam50bQ9WTJ8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fam50bQ9WTJ8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Fam50bQ9WTJ8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Fam50bQ9WTJ8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fam50bQ9WTJ8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fam50bQ9WTJ8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fam50bQ9WTJ8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fam50bQ9WTJ8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fam50bQ9WTJ8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fam50bQ9WTJ8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fam50bQ9WTJ8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fam50bQ9WTJ8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fam50bQ9WTJ8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fam50bQ9WTJ8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fam50bQ9WTJ8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fam50bQ9WTJ8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fam50bQ9WTJ8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fam50bQ9WTJ8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fam50bQ9WTJ8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fam50bQ9WTJ8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fam50bQ9WTJ8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fam50bQ9WTJ8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fam50bQ9WTJ8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fam50bQ9WTJ8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fam50bQ9WTJ8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fam50bQ9WTJ8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fam50bQ9WTJ8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms