Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P3

Psmb2, Proteasome subunit beta type-2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb2Q9R1P3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms