Protein–RNA interactions for Protein: Q9R155

Slc26a4, Pendrin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a4Q9R155 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Slc26a4Q9R155 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc26a4Q9R155 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc26a4Q9R155 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc26a4Q9R155 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc26a4Q9R155 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc26a4Q9R155 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc26a4Q9R155 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc26a4Q9R155 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc26a4Q9R155 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc26a4Q9R155 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc26a4Q9R155 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc26a4Q9R155 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc26a4Q9R155 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc26a4Q9R155 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc26a4Q9R155 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc26a4Q9R155 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc26a4Q9R155 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc26a4Q9R155 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc26a4Q9R155 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc26a4Q9R155 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc26a4Q9R155 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc26a4Q9R155 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc26a4Q9R155 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc26a4Q9R155 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc26a4Q9R155 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc26a4Q9R155 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc26a4Q9R155 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc26a4Q9R155 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc26a4Q9R155 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc26a4Q9R155 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc26a4Q9R155 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc26a4Q9R155 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc26a4Q9R155 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc26a4Q9R155 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc26a4Q9R155 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc26a4Q9R155 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc26a4Q9R155 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc26a4Q9R155 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc26a4Q9R155 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc26a4Q9R155 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc26a4Q9R155 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc26a4Q9R155 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc26a4Q9R155 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc26a4Q9R155 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc26a4Q9R155 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc26a4Q9R155 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc26a4Q9R155 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc26a4Q9R155 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms