Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrpxQ9R0M3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrpxQ9R0M3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrpxQ9R0M3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrpxQ9R0M3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SrpxQ9R0M3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrpxQ9R0M3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrpxQ9R0M3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrpxQ9R0M3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrpxQ9R0M3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpxQ9R0M3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpxQ9R0M3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpxQ9R0M3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpxQ9R0M3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpxQ9R0M3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpxQ9R0M3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpxQ9R0M3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpxQ9R0M3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpxQ9R0M3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpxQ9R0M3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpxQ9R0M3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpxQ9R0M3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpxQ9R0M3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpxQ9R0M3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpxQ9R0M3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrpxQ9R0M3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrpxQ9R0M3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrpxQ9R0M3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrpxQ9R0M3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrpxQ9R0M3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrpxQ9R0M3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrpxQ9R0M3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrpxQ9R0M3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrpxQ9R0M3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrpxQ9R0M3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrpxQ9R0M3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SrpxQ9R0M3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SrpxQ9R0M3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms