Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nek3Q9R0A5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms