Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prkab1Q9R078 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prkab1Q9R078 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prkab1Q9R078 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prkab1Q9R078 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prkab1Q9R078 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prkab1Q9R078 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Prkab1Q9R078 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prkab1Q9R078 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Prkab1Q9R078 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prkab1Q9R078 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prkab1Q9R078 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prkab1Q9R078 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prkab1Q9R078 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prkab1Q9R078 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prkab1Q9R078 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prkab1Q9R078 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prkab1Q9R078 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prkab1Q9R078 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Prkab1Q9R078 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prkab1Q9R078 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prkab1Q9R078 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prkab1Q9R078 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Prkab1Q9R078 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prkab1Q9R078 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prkab1Q9R078 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prkab1Q9R078 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prkab1Q9R078 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prkab1Q9R078 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prkab1Q9R078 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prkab1Q9R078 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prkab1Q9R078 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prkab1Q9R078 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prkab1Q9R078 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prkab1Q9R078 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prkab1Q9R078 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prkab1Q9R078 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prkab1Q9R078 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prkab1Q9R078 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkab1Q9R078 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkab1Q9R078 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkab1Q9R078 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkab1Q9R078 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkab1Q9R078 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkab1Q9R078 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkab1Q9R078 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkab1Q9R078 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkab1Q9R078 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkab1Q9R078 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prkab1Q9R078 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prkab1Q9R078 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prkab1Q9R078 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prkab1Q9R078 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prkab1Q9R078 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Prkab1Q9R078 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prkab1Q9R078 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prkab1Q9R078 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prkab1Q9R078 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prkab1Q9R078 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Prkab1Q9R078 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms