Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BcamQ9R069 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BcamQ9R069 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BcamQ9R069 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BcamQ9R069 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BcamQ9R069 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BcamQ9R069 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BcamQ9R069 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BcamQ9R069 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BcamQ9R069 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BcamQ9R069 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BcamQ9R069 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BcamQ9R069 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BcamQ9R069 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BcamQ9R069 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BcamQ9R069 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BcamQ9R069 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BcamQ9R069 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BcamQ9R069 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BcamQ9R069 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BcamQ9R069 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BcamQ9R069 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BcamQ9R069 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BcamQ9R069 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BcamQ9R069 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BcamQ9R069 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BcamQ9R069 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BcamQ9R069 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BcamQ9R069 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BcamQ9R069 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BcamQ9R069 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BcamQ9R069 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BcamQ9R069 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BcamQ9R069 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BcamQ9R069 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BcamQ9R069 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BcamQ9R069 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BcamQ9R069 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BcamQ9R069 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BcamQ9R069 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BcamQ9R069 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BcamQ9R069 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BcamQ9R069 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BcamQ9R069 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BcamQ9R069 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BcamQ9R069 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BcamQ9R069 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BcamQ9R069 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BcamQ9R069 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BcamQ9R069 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BcamQ9R069 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BcamQ9R069 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BcamQ9R069 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BcamQ9R069 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BcamQ9R069 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BcamQ9R069 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BcamQ9R069 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BcamQ9R069 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BcamQ9R069 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BcamQ9R069 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BcamQ9R069 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BcamQ9R069 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms