Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fhl3Q9R059 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms