Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CtsjQ9R014 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CtsjQ9R014 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CtsjQ9R014 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms