Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms