Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN7

Tlr2, Toll-like receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr2Q9QUN7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr2Q9QUN7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr2Q9QUN7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr2Q9QUN7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr2Q9QUN7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr2Q9QUN7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr2Q9QUN7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr2Q9QUN7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr2Q9QUN7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr2Q9QUN7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr2Q9QUN7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr2Q9QUN7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr2Q9QUN7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr2Q9QUN7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr2Q9QUN7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr2Q9QUN7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr2Q9QUN7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr2Q9QUN7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr2Q9QUN7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tlr2Q9QUN7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tlr2Q9QUN7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tlr2Q9QUN7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tlr2Q9QUN7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr2Q9QUN7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr2Q9QUN7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr2Q9QUN7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr2Q9QUN7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr2Q9QUN7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr2Q9QUN7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr2Q9QUN7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr2Q9QUN7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr2Q9QUN7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr2Q9QUN7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr2Q9QUN7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr2Q9QUN7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr2Q9QUN7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr2Q9QUN7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr2Q9QUN7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr2Q9QUN7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr2Q9QUN7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr2Q9QUN7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr2Q9QUN7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr2Q9QUN7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr2Q9QUN7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr2Q9QUN7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr2Q9QUN7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr2Q9QUN7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr2Q9QUN7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr2Q9QUN7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr2Q9QUN7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr2Q9QUN7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tlr2Q9QUN7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tlr2Q9QUN7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tlr2Q9QUN7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tlr2Q9QUN7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tlr2Q9QUN7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms